GEO公共數(shù)據(jù)庫中4例多指畸形患者細胞間質(zhì)和上皮細胞的單細胞轉(zhuǎn)錄組分析

摘要： 背景：多指畸形患者中參與Heghog信號通路的一些轉(zhuǎn)錄因子發(fā)生異常表達，這些轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控大量靶基因的表達，從而影響細胞的功能。目的：通過單細胞轉(zhuǎn)錄組分析多指畸形患者的轉(zhuǎn)錄組特征。方法：從GEO公共數(shù)據(jù)庫中下載4例多指畸形患者細胞間質(zhì)和上皮細胞的單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，將成纖維細胞和角質(zhì)細胞劃分為細胞亞群，并分析不同亞群的轉(zhuǎn)錄因子，構(gòu)建轉(zhuǎn)錄因子及其靶基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，分析調(diào)控因子的功能。... ... （共10頁）