2018—2021年烏魯木齊市鼠傷寒沙門菌基因組特征分析
摘要: 目的 分析2018—2021年烏魯木齊市鼠傷寒沙門菌(S.1,4,[5],12:i:1,2)的基因組特征,為該菌的流行監(jiān)測(cè)及引起的疫情處置提供依據(jù)。方法 收集26株烏魯木齊市腸道門診監(jiān)測(cè)腹瀉樣本分離的鼠傷寒沙門菌,利用全基因組測(cè)序(WGS)結(jié)合生物信息學(xué)分析MLST類型、核心基因組多位點(diǎn)序列(cgMLST)型別、質(zhì)粒、耐藥基因和毒力基因特征,通過(guò)全基因組單核苷酸多態(tài)性(wgSN... ...
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