依據(jù)云南栘[木衣]種子萌發(fā)至成苗期間轉(zhuǎn)錄組的SSR、SNP及InDel特征

摘要： 依據(jù)云南栘[木衣](Docynia delavayi(Franch.) Schneid.)種子萌發(fā)至成苗期間的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，分別使用MISA、GATK3軟件對SSR、SNP、InDel位點進行挖掘并進行特征分析。結(jié)果表明：從轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的63 782個非冗余基因序列(unigene)中，共挖掘出76 981個SSR位點，其發(fā)生頻率為30.18%。在各種不同的重復(fù)基元種類里，重復(fù)出現(xiàn)... （共7頁）